便宜上あるかもしれません。 ただお客様が契約内容を実質的に了承していることが前提となります。

お客様に落ち度がなければ経年劣化となります。その場合家主が負担することになります。速やかに管理会社に報告してください。

更新時に「仲介手数料」を請求されたとのことですが、契約更新時に仲介手数料は発生しませんので、もちろん支払義務はありません。

双方納得であれば問題ないと思いますよ！

滞納や夜逃げは経済面だけでなく信用を大きく傷つけます。今後は地道に信用を重ねていくほか無いでしょう。

お客様は退去の必要はなく引続き入居することが出来ます（ただし定期借家契約は除く）とはいえ、家主側からの提案がお客様の納得できる条件（立退き料など）でしたら立退きを承諾することも選択肢の一つといえます。現状で退去したくなければお断りをすれば良いということになります。